然而有人提出了这样的疑问：如果是物质不灭守恒，世界真的像是陈健说的那样只是微粒的重新组合。那么植物焚烧后可以产生碳酸气、水。
那么刨除掉空气中氧气的存在，可以证明植物中肯定有炭和氢，有没有氧还不清楚。
氢很好解释，植物生长要浇水嘛，不浇水植物就活不了，所以不管有没有氧，氢的问题可以解决。
但是碳呢？碳从哪来的？
植物施肥，不需要施木炭。原本以为草木灰中含有植物的生灵所以可以促进植物的生长，但按照陈健的说法施氯化钾或是碳酸钾有一样的效果。所以排除掉草木灰中的碳的存在。
然后这个质疑的人将种植植物的沙土进行了加热、燃烧，确定沙土中没有碳的存在，加热后澄清的石灰水没有变浑浊。然后又将可以确定没有碳的砂砾和配好的肥料进行了植株培养，这可以确保植物不会从根部获得碳。
于是前两派的反对者们都兴奋起来，认为这件事彻底扭转了局势。陈健的那套体系明显错了，如果真的是物质不灭重新组合而且不可分之物不可转化，那么植物中的碳从何来？如果植物可以变出碳，是不是炼金术并不是没有可能的？只是大家没有找到办法？
然而想要搞修正的那一派却主动帮陈健找出了这个实验的漏洞，认为这个实验没有考虑到空气中的碳酸气的存在。
他们这一派大约明白陈健的这个体系只怕内部是圆的上的，基本上没办法在逻辑上反驳。与其在直接推翻上浪费时间，还不如深入内部进行修正，他们可以承认物质不灭守恒，但却可以找出生于死之间的鸿沟，从而完成在物质不灭前提下生灵或是人格灵魂这种神秘植物存在的概念。
不是瓦解，只是修正。
第三支反对派的人不但设计了一个植物可以从空气中获取碳酸气的实验，还同样验证了一件事：植物在白天吸收碳酸气放出氧气，晚上吸收氧气排出碳酸气。
在陈健的微粒体系之内提出了植物呼吸这一说法，生动详实而又不可反驳的实验让这个人获得了很高的名声。
获得名声后，他立刻开始修正陈健的那套体系。
既以陈健的支持者自居，又尊陈健为先生，却又趁着陈健在海上不能回答写了一篇洋洋洒洒的文章，要将陈健弄出的这套体系在世界观上修正掉。
按照物质不灭的体系，天地之初是否有生命都是无意义的，有也可以，没有也可以，所谓生命只是微粒的某种聚合。可能出现，也可能不出现，可以是必然也可以是偶然。
既然这样，一切天地人格论、灵魂论、生灵论、生死鸿沟论，都从世界观上失去了统治地位。
这是很多人所不能接受的，而且是绝对不能接受的。
但是，如果物质不灭，但是生命从天地初开之时就已经诞生、生者与无生机者之间有一条不可逾越的鸿沟，不管是人格、灵魂、万物之灵等等，都可以变得和陈健的体系不矛盾。
的确，物质不灭，但生物死物之间有越不过去的鸿沟啊，物质的不灭的，可生命却是早已注定的，生命属于物质但又不同于物质，所以对人而言物质不是第一性。
生者之物高于无生之物，生者之物可以依据物质不灭理论拆分成一切，也可以将无生之物变为有生之物，但这个过程却是不可逆的。之所以不可逆，那就是有某种神秘的、开天辟地之初就存在的、和生命灵魂之类息息相关的东西。
基本上到了这时候，之前痛骂这人的反对派们才明白此人的良苦用心，顿觉可以互相扶持一起对抗陈健的体系，扭扭捏捏地承认了陈健的体系“或许有一定道理，但很显然不完善”，大张旗鼓地为那个人站台。
往小了看，这就是个屁事，或者只是个化学或是植物学上的事。
但实际上，这是世界观之争，也是物质第一性和唯物无神论的化学基础：物质与人格天之间的创世之争。人格天到底有没有生命的世界观之争。
一番造势之后，那人用了陈健的那本《归纳总结和逻辑演绎》狂抽陈健的脸——如今还没有任何实验可以逾越生物与无生之物，所以他的说法未必对也未必不对，但说他不对是肯定不对的。你们不是讲逻辑吗？你们讲逻辑就不能说我说的不对，除非你们真的创生。你们要是不讲逻辑，那你们的一切体系都是错误的崩塌的。
这番修正与造势的时候，陈健正在海上飘荡，因而这大嘴巴子抽的啪啪响，却没人能反驳，造成了巨大的思想混乱。修正的东西最难反驳，而且看起来比之直接反对派更温和也更无害，也更容易蛊惑更多的人，毕竟这理论还是承认物质不灭论的。
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