故事大概的情节是：以秋叶原为据点的三人发明小组“未来发明研究所”队长，改不了中二病的东京电机大学大一学生冈部伦太郎和他的伙伴们终日重复着古怪发明的开发。
2010年7月28日，冈部为了取得学分和同级的好友桥田至一同去了讲义会场，在那里，他们遇见了年仅18岁就成功在美国科学杂志刊登论文的天才少女牧濑红莉栖。
然而古怪的是，冈部在几个小时前刚刚目睹了在RADIO会馆8楼晕倒在血泊中的牧濑。更让人费解的是，这一切在一周前发送给桥田的手机短信中都记载的清清楚楚。
最后冈部查明，原来他们发明的其中一件发明装置中偶然具有了向过去发送短信的功能，也就是具备了时光机类似的机能。
而这个时候的冈部连想都没想过这一个偶然的发明将会成为左右世界未来的钥匙，世纪大发明诞生了……
前世这部作品被许多人评价为神作，但也不乏对它感到不明所以的人。
但是不管看不看得懂，看不看得下去，所有人都一定被这部游戏所科普给众多玩家的「世界线收束理论」所惊艳到过。
就像姜煜前世一直听说过《三体》的大名，也对「黑暗森林法则」有所耳闻。但是直到姜煜自己看完了《三体》之后，激动的内心依然久久无法平静。
所谓「世界线收束理论」，即世界线通向共同的结果。
一个世界，无数个可能性分支（世界线），把SG世界中的世界系统看做量子系统的量子纠缠态，这里以世界线纠缠态来指代。
无数的可能性世界线纠缠在一起构成了世界线收束范围，无数的世界线收束范围构成了更大的世界线收束范围，类似于1-2-4-8-16-32-16-8-4-2-1这样的纺锤形结构。
而具体到纠缠态中的世界的表现状态，这是由观测者决定的事情。
需要注意的是，因为“观测者”的存在，导致SG中的不同世界线处于构建-坍塌-再构建的状态，即单一宇宙论，而非平行宇宙论。
这也是「因果律的融解」一章中，牧濑红莉牺为了让男主角下决心放弃自己，所回避的问题。她并不会在另一个平行世界活下去。因为在这条世界线的观测者——凤凰院凶真的认知里，牧濑红莉栖已经死亡。这也显得这种抉择异常悲壮。
这种单一宇宙是类似于粒子的量子叠加态，存在着“无限的可能性”。
在这里提一下喜闻乐见、大快人心的“薛定谔的猫”这个经典哥本哈根诠释。观测决定猫的死与活，在观测前猫将一直处于生与死的叠加态。因为我们不知道未来，所以猫的死活这一结果一定会收束。
因为观测者的存在，一个事件只有一个确定性结果，但结果取决于观测结果。同一事件叠加的可能性有无数种，但形成确定结果的只有一种。
简单来说，如果你正在被观测，观测者知道你一定会死，但是他在尽力避免你的死亡这一结果。
如果你避开了突然掉落的钢筋，自然法则就会进行干涉，那么下次你可能会因为接触到泄漏的电流而死亡。
这就有点死神来了的味道了，只不过脱离了超自然的因素，整个理论建立在相对论、量子力学、M理论的混合之上。
就像是游戏里冈部伦太郎为了避免椎名真由理的死亡，而不停地通过时间机器穿梭回过去，试图去拯救椎名真由理，改变她的死亡的这一结局。
然而冈部伦太郎却是在不停地做着无用功，无论他回到多少次过去，在他的认知和世界的认知里，在这条世界线里，椎名真由理的死亡是无法避免的。
而「命运石之门」厉害的地方在于，它不是一股脑地在开头将这个理论抛给你，而是玩家们随着凤凰院凶真的视角，在椎名真由理一次次的被杀中逐步得出这个结论，更加添加了解密的意味。
所以当我们随着凤凰院凶真的视角，历经了多少次见证椎名真由理的被杀，多少次回到过去，见证了打工战士写满了整页纸的“失败了”“失败了”“失败了”，牺牲了琉佳子想要变成女性的愿望，牺牲了菲利斯想要和父亲在一起的愿望，最后甚至牺牲了牧濑红莉栖的性命，才换回了椎名真由理的重生。
而在最后，在凶真癫狂地发表着胜利宣言和真由理的那句“没事了，小冈部可以为自己哭了”中，那种悲伤感，真的是难以言表。
然而牺牲并不能换取最终的胜利，这才是游戏剧本给出的牺牲结局所悲哀的地方。
牺牲真由理，导致世界被SERN所掌控，伪乌托邦形成；牺牲牧濑红莉栖，由于时间机器的开发而引发军备竞赛，从而爆发了世界大战，导致大多数人类都死亡。
因此最后，凤凰院凶真开始寻找真正的「命运石之门」世界线，即椎名真由理以及牧濑红莉栖都存活的世界线。
而寻找的过程也颇耐人寻味，甚至还出现了“牧濑红莉栖死亡的世界线”里未来的冈部伦太郎对于过去的自己所做出的提醒。
“不改变牧濑红莉栖‘死亡’的过去而去拯救她。”，去“欺骗过去的自己”，“不改变过去的既成事实，去改变结果吧！”。
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