故事回到蝙蝠侠一行。
从天堂岛返回，蝙蝠侠立刻开始动用所有资源寻找母盒下落，并召集正义联盟，与此同时，还展开了与联合国的沟通。
联合国方面隐匿了己方已经获得一只母盒的情况，还对蝙蝠侠一方表达了不信任，理由是当初亚马逊人坚持三只母盒都放在天堂岛是安全的，结果她们失败了。
神奇女侠做出反击，表示如果母盒在人类手中，荒原狼第一次攻击或许就拿到了全部三只母盒，并毁灭地球。
双方再次不欢而散。
回到蝙蝠洞，感受到荒原狼的强大威胁，受困于人类内部的纷争，疲倦的蝙蝠侠做了一个噩梦，梦到地球抗击荒原狼的战争最终失败，哥谭、大都会、中心城都化作一片废墟。
从噩梦中惊醒，看着神奇女侠、闪电侠等几位同伴，蝙蝠侠产生了悲观的质疑。
我们真能成功吗？
大家却明白，布鲁斯·韦恩想到了已经逝去的超人。
私下对话中，钢骨向戴安娜透露了一个想法，可以尝试利用母盒的力量，如同他当初遭遇一样，复活超人。
然而，这件事的风险很大。
首先，团队没有母盒。
其次，哪怕得到母盒，他们复活的，也很可能是另外一个‘毁灭日’，超越当初来克斯·卢瑟变异而成的更加强大的‘毁灭日’。
故事继续推进。
拿到了一只母盒的荒原狼获得了助力，利用母盒的力量对地球发动了一次打击，毁灭了一座城市，同时向人类发出通牒，要求协助寻找另外两只母盒。
荒原狼还许诺，只要拿到三只母盒，他会立刻带着自己的外星大军离开。
眼看那座被毁灭城市的惨状，人类社会同样陷入分裂。
有人倾向于帮忙寻回母盒，交给荒原狼，以便送走这尊瘟神。
有人不相信荒原狼拿到三只母盒后会轻易离开，理由是对方已经毁灭了一座城市，那么，将来毁灭一个星球，也不是没有可能，因此主张反击。
亚特兰蒂斯。
涉及到整个世界的生死存亡，流浪在外的亚瑟·库瑞终于返回，一番讨论，暂时答应执掌国王权柄，同时，因为之前在《钢骨2》中的合作，亚瑟主动与正义联盟团队取得了联系。
复活超人的一个障碍解决。
随即是一个圆桌会议。
蝙蝠侠、神奇女侠、闪电侠、钢骨、火星猎人和刚刚加入的海王亚瑟·库瑞。
投票是三比三。
陷入僵持。
随后是钢骨提出了一个灵魂拷问，如果是克拉克·肯特本人坐在这里，他会选择继续守护人类，还是置身事外？
这边争执中，人类向停泊在宇宙中的荒原狼大军做出了试探。
最强大的核武器，没能伤到荒原狼大军分毫，结果是另外一座千万人口大都市的毁灭。
另外一个结果，是正义联盟决定复活超人。
过程有些坎坷，结果，不好不坏。
克拉克·肯特顺利醒来，记忆残缺，与几位正联成员发生了冲突，直到露易丝·来恩及时出现，安抚住了超人，才避免了更加严重的后果。
暂时还没有完全恢复的超人带着露易丝·来恩离开，大家有些失望，又觉得，至少，克拉克没有变成升级版毁灭日，事情还算不错。
荒原狼的最后通牒时间越来越近。
正联方面已经决定不把母盒交给对方，开始积极准备战斗，这时候，问题再次出现。用于复活超人的母盒，意外地进入了封印状态，无法再用于为蝙蝠侠的正义装甲提供能量。
这件事并没有持续多久，转折也很快到来。
猫女游说下，自杀小队反水，从联合国手中抢回了他们之前获得的母盒，交给蝙蝠侠，正义装甲因此得以补全，正义联盟也获得了猫女、毒藤女、瑞克队长、死亡射手等编外力量。
最后通牒时间到，荒原狼向地球发起了进攻。
人类也展开反击，但力量有限，只能作为辅助于对抗荒原狼的类魔大军。
正义联盟和编外团队启动。
决战开启。
持续二十多分钟的壮阔战争场面，让神圣公民大礼堂内的众人惊呼连连。
超人也不负众望，在荒原狼几乎要杀死蝙蝠侠的关键时刻，突然出现，成为扭转战局的最后力量。最终结果，正义联盟团队一路将荒原狼大军反推回了外太空，并彻底摧毁了荒原狼的外星舰队。
正义再一次击败邪恶，成功拯救世界。
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