十多日之后，上杉谦信指挥的日本中央军顺利攻占了福井，打掉了叛军最后一个据点。随着最后一支大股叛军被消灭，日本平叛战争基本上宣告结束。此时，只有陆奥，上野，信浓，美浓四个地区的山区里面还有部分叛军在活动。而围剿这些叛军的战斗将持续到十多年之后。不过，这些叛军根本就成不了气候，随着天皇影响力的扩大，以上杉将军幕府在日本各地的树立起强大的威望，日本的战乱基本上告以段落了。
朱祁钰也带着明军将领返回了东京，天皇已经在这之前宣布将正式定都东京，前首都京都将成为天皇的皇家封地，并且正式开始在东京前江户城的地点修建新的宫殿。当然，天皇这次赶到了立川前来迎接明帝国皇帝朱祁钰，并且完全以臣子的身份向朱祁钰表示了臣服，承认了日本为明帝国藩属国的地位，也承认了天皇本身仅位明帝国之下一普通王国国王的身份。
回到东京之后，自然免不了一番庆祝，而朱祁钰也要为这次的日本平叛战争画下一个圆满的句号。从西军首起叛乱，攻占京都，到最后福井城被光复，叛军大股部队全部被歼灭，整场平叛战争持续了一年零十个月，而朱祁钰也在日本呆了一年半的时间。现在，他必须要为这场持续了一年多的战争画上一个句号，并且为日本新时代的开始留下浓重的一笔。作为日本君主国的皇帝，他也是日本的主人，按照朱祁钰的想法，就算他没有要让日本发展壮大的意思，不过，他有责任让日本保持稳定，并且让帝国商人，帝国的百姓能够在日本自由活动，而不受到任何的影响与危害。当然，这就需要他这个帝国皇帝在战争结束之后，将帝国的利益用条约的方式确定下来！
《明日东京条约》在继《明日马关条约》之后，又一份两个国家之间的不平等条约。从根本上讲，《明日东京条约》是《明日马关条约》的继续，也是对前一条约的完善与发展。很多原本在《明日马关条约》中没有详细规定，甚至没有提到的一些关系到两国利益的细节问题，在这份新的条约中都加以了详细的说明与规定。当然，双方签订《明日东京条约》已经是大半年之后的事情了，而且代表明帝国在条约上签字的并不是朱祁钰，而是外交部部长何山。当然，朱祁钰在这里所做的，就是先与天皇，准确的说，是日本幕府将军，日本真正的掌权者上杉谦信达成了协议，开始了签署这份条约的谈判工作。也就是在此之后，双方代表才先后在日本首都东京，以及明帝国的首都进行了数轮谈判，并且最后在东京签署了这份条约，这也就是《明日东京条约》的来历！
因为这份条约中很多条款都是永久性的，比如日本割让屋久岛以南诸岛给琉球王国，并且将种子岛，以及周围数十座岛屿连同九州岛一起割让给明帝国。比如日本永久开放马关，神户，大阪，名古屋，静冈，横滨六地，并且由明帝国在这六地设置租界，租界内，有外交，法律等赦免权。比如日本政府给予明帝国商人最优惠贸易权。比如日本全面开放国内市场，并且将中央军数量限制在二十万以下。还有很多，都是永久性的条款，所以直到现在，这份条约都仍然保存在帝国博物馆，以及帝国档案馆里，一直以来，都供帝国百姓参观，并且是明帝国一直坚持对日外交政策的基础性文件！
条约谈判，签署条约，可以说是当时的头等大事。从根本上讲，这是一份实现明帝国在日利益，并且保障明帝国在日利益的条约，对日本是没有多少好处的。不过，当时的日本天皇，还有幕府都需要明帝国的支持，更需要明帝国皇帝的支持，所以他们也非常重视这份条约，在日本天皇看来，这份条约可以保证他今后仍然是日本天皇，而不是神秘的失踪，不会神秘死亡。而在上杉谦信看来，要想日本保持稳定，那就必须要付出一些代价，而且条约中并不是没有对日本没有一点好处。随着贸易的发展，日本也肯定会从与明帝国的交往中获得好处，就如同当年日本遣使去唐王朝一样，总会从相互的交往中获得好处！
与《明日东京条约》谈判工作同时展开的还有这次平叛战争军费消耗的谈判。按照之前朱祁钰与日本天皇，以及上杉谦信达成的协议。这次平叛战争，是明帝国出兵协助天皇与上杉谦信平定日本国内叛乱，并且保证《马关条约》中规定由明帝国获得的利益。所以，赴日作战的明军战争消耗，伤亡军人抚恤金，以及其他各方面的军费都将由日本承担。只不过，日本当时根本就拿不出一分钱来支付这笔庞大的军费，这就需要双方通过谈判来解决这一问题。当然这一谈判就容易得多了，双方需要确定的只是各笔战争开支的大小而已！
当然，朱祁钰没有参加这些谈判，也轮不到明帝国的皇帝来操心这些细节方面的事情。在战争结束之后，于谦就已经派了大批的官员过来，专门负责外交方面的谈判工作。当然，于谦也极为重视这两个谈判，明帝国在这场战争中耗费巨大，如果找不到一点补偿，如果无法从战后获取更多的利益的话，那不成了亏本买卖了？显然，在这一点上，于谦已经受到了丁用这些商人出身大臣的严重影响！
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